En mi opinión y basado en la forma en que yo veo las cosas, el gran problema con llevar historias de videojuegos a series/películas/animes/lo que sea radica en que las historias de los videojuegos nunca son realmente "buenas" historias. Encuentro que hay muchas historias "suficientes" para que los jugadores que tienen dificultades en justificar sus acciones dentro de un videojuego puedan hacerlo. Yo no soy de ese tipo de jugadores y por eso me cuesta tanto empatizar (en el fondo, citando el caso de zelda: Muchos juegan para salvar la a princesa zelda del malvado Ganon y así regresar Hyrule a un estado de paz y continuar con la historia. Yo juego simplemente para "pasar el nivel" y vencer al "jefe final". No se si queda clara la diferencia)

Las historias son el medio y no el fin de la mayoría de los videojuegos. El principal componente de los videojuegos al final del día es la interacción jugador-sistema. Por eso, a mi por ejemplo, me aburren mucho los juegos tipo novelas visuales ó rpgs con un fuerte componente en su historia (esto último se lo perdono si las cutscenes son saltables). 

Como en una película el componente interacción es inexistente, uno como espectador puede focalizar mucho más su atención en seguir la historia (guión y cinematografía en su conjunto) y aceptar una que otra concesión hasta el punto de quiebre (sí la historia para ese espectador en particular no resulta del todo bien construida. Al final del día, todo esto es subjetivo). 

Las "buenas" películas basadas en videojuegos usualmente tienen otros componentes que las hacen más atractivas y la historia en sí misma siempre queda de lado, en mi opinión. Iban a ser buenas películas igual, sin necesariamente llevar el título del juego en cuestión. 

parece que los videojuegos solo pueden funcionar si es una serie